師資陣容
本所現階段共由14名專任及合聘師資組成，其中教授8名、副教授6名，目前亦持續地延攬優秀之研究人才。現有師資之重要學術成就及專長介紹如下。
| 教授兼所長 | |
| 學位 | 日本東京海洋大學博士 |
| 專長 | 魚類生理、生殖生理、珊瑚生殖生物學、基因工程 |
| 學術榮譽 | 本校109學年度學術優良教師，日本水產年會「令和2年度水産學獎勵賞」 |
| 電子郵件 |
shikinash@gmail.com ; shikina@mail.ntou.edu.tw |
| 分機 | 5715 |
| 網站 | 珊瑚生物與保育實驗室 : https://sites.google.com/view/the-shikina-lab/home |
| 終身特聘教授 | |
| 學位 | 國立台灣大學海洋研究所博士 |
| 專長 | 海洋環境化學、海水水質、海洋基礎生產力、海洋水色 |
| 學術榮譽 | 國家科學委員會91年度傑出研究獎，本校95年度學術成就獎，本校終身特聘教授 |
| 電子郵件 | gcgong@mail.ntou.edu.tw |
| 分機 | 5701 |
| 特聘教授 | |
| 學位 | 日本東北大學海洋環境學博士 |
| 專長 | 海洋植物性浮游生物與微生物環生態學 |
| 學術榮譽 | 本校93學年度教學優良教師，本校98學年度學術優良教師，本校101學年度教學優良教師，本校102年度特聘教授，本校107年度特聘教授，本校產學研究成就獎 |
| 電子郵件 | kpchiang@mail.ntou.edu.tw |
| 分機 | 5019 |
| 教授 | |
| 學位 | 國立中山大學海洋地質及化學博士 |
| 專長 | 化學海洋學、海洋碳化學、穩定同位素地球化學 |
| 學術榮譽 | 本校100學年度學術優良教師 |
| 電子郵件 | wcchou@mail.ntou.edu.tw | 分機 | 5703 |
| 教授 | |
| 學位 | 國立台灣海洋大學環境生物與漁業科學研究所博士 |
| 專長 | 海洋生態學，生態模式研究，環境生物學 |
| 學術榮譽 | 本院102學年度教學優良教師，本校103年度研究績優教師，本校105年度研究績優教師 |
| 電子郵件 | anyitsai@mail.ntou.edu.tw |
| 分機 | 5705 |
| 副教授兼本校船務中心主任 | |
| 學位 | 國立臺灣海洋大學海洋生物研究所博士 |
| 專長 | 生物海洋學、海洋分子生態學、分子生物技術 |
| 學術榮譽 | |
| 電子郵件 | chungcc@mail.ntou.edu.tw | 分機 | 5704 |
| 副教授 兼 本校社會責任實踐與永續發展中心永續發展組組長 | |
| 學位 | 美國康乃狄克大學海洋科學博士 |
| 專長 | 有機地球化學, 微生物生態學 |
| 學術榮譽 | |
| 電子郵件 | tzongyueh.chen@gmail.com |
| 分機 | 5702 |
| 副教授 | |
| 學位 | 西班牙加的斯大學海洋與海岸管理博士 |
| 專長 | 海洋與海岸管理，環境與氣候變遷，溫室效應氣體量測，化學海洋學 |
| 學術榮譽 | |
| 電子郵件 | hctseng@email.ntou.edu.tw |
| 分機 | 5714 |
| 網站 | 曾老師的研究天地：https://sites.google.com/view/tseng-lab |
| 副教授兼本校環安組組長 | |
| 學位 | 國立中山大學海洋環境及工程學博士 |
| 專長 | 海洋塑膠微粒、海洋微膠、海洋污染生態風險與控制技術、微生物胞外聚合物分泌行為 |
| 學術榮譽 |
研究室網站: https://sites.google.com/view/rueifengshiu/ |
| 電子郵件 | rfshiu@mail.ntou.edu.tw |
| 分機 | 5711 |
| 中研院環變中心副主任暨本所合聘教授 | ||
| 學位 | 美國馬里蘭大學海洋河口環境科學系博士 | |
| 專長 | 生物海洋學、微生物生態學、河口及系統生態學 | |
| 學術榮譽 | 國家科學委員會九十年度傑出研究獎 | |
| 電子郵件 | fkshiah@gate.sinica.edu.tw | |
| 合聘助理研究員 | |
| 學位 | 國立台灣海洋大學環境生物與漁業科學研究所博士 |
| 專長 |
海洋真核生物、微生物生態學、植物性浮游生物 |
| 學術榮譽 | |
| 電子郵件 | yunchi@mail.ntou.edu.tw |
| 分機 | 5290 |
| 合聘教授 | |
| 學位 | 澳洲墨爾本大學微生物及免疫學研究所博士 |
| 專長 | 微生物生態學、多源基因體學和相關生物資訊學、環境病毒學等。 |
| 學術榮譽 | |
| 電子郵件 | sltang@gate.sinica.edu.tw |
| 分機 | 02-2789-3863 |
| 合聘教授 | |
| 學位 | 美國羅德島大學海洋研究院博士 |
| 專長 | 系統生態學、濕地生態學、溪流生態學、生態系模式 |
| 學術榮譽 | |
| 電子郵件 | hjlin@dragon.nchu.edu.tw |
| 分機 | 04-22840416#510、511 |